Εμπορικές είναι οι διαφορές μεταξύ των εμπόρων, φυσικών προσώπων ή εταιριών, καθώς και μεταξύ των εταίρων τους (εσωτερικές εταιρικές διαφορές). Οφειλές, καθυστερημένη εκπλήρωση παροχών, ευθύνη προς τρίτους είναι μερικά από τα ζητήματα που προκύπτουν συχνότατα στις πολυσχιδείς και πολυποίκιλες εμπορικές σχέσεις και συναλλαγές.
Η επίλυση των διαφορών αυτών μέσω της διαμεσολάβησης αποδεικνύεται ιδιαίτερα ωφέλιμη λόγω της γρήγορης και ειρηνικής φύσεώς της, που επιτρέπει στα μέρη να μην τερματίσουν τις εμπορικές τους σχέσεις, αλλά να συνεχίσουν τη συνεργασία τους, καθώς και της ιδιωτικότητας κι εχεμύθειας που διέπει τη διαδικασία, που προστατεύει τη φήμη των εμπλεκομένων εταιριών, οι οποίες κατ’αυτό τον τρόπο αποφεύγουν την έκθεση στη δημοσιότητα, που επιφέρει μια δικαστική αντιδικία.